Produkter

Genom-wide chromatin immunoprecipitation (ChIP) undersøgelser har bragt betydelig indsigt i den genomiske lokalisering af kromatin-associerede proteiner og histon modifikationer.Den store mængde data, der genereres af disse analyser, kræver imidlertid tilgange, der muliggør hurtig validering og analyse af biologisk relevans.Ydermere er der stadig protein- og modifikationsmål, som er svære at påvise ved brug af standard ChIP-metoder.For at løse disse problemer udviklede vi en øjeblikkelig kromatin-immunpræcipitationsprocedure, som vi kalder ZipChip.ZipChip reducerer tiden betydeligt og øger følsomheden, hvilket giver mulighed for hurtig screening af flere loci.Her beskriver vi, hvordan ZipChIP muliggør påvisning af histonmodifikationer (H3K4 mono- og trimethylering) og to gærhistondemethylaser, Jhd2 og Rph1, som tidligere var svære at påvise ved brug af standardmetoder.Desuden demonstrerer vi alsidigheden af ​​ZipChIP ved at analysere berigelsen af ​​histon deacet ylase Sir2 ved heterochromatin i gær og berigelse af kromatin remodeler, PICKLE, ved euchromatin i Arabidopsis thaliana.