6-Chloropurin CAS:87-42-3 Lysegult pulver
Katalognummer | XD90547 |
produktnavn | 6-klorpurin |
CAS | 87-42-3 |
Molekylær formel | C5H3ClN4 |
Molekylær vægt | 154.557 |
Opbevaringsdetaljer | 2 til 8 °C |
Harmoniseret tarifkode | 2933990090 |
Produkt specifikation
Udseende | Lysegult pulver |
Assay | 99 % |
Vi har for nylig rapporteret, at pyrennukleotid fortrinsvis indsættes overfor et abasisk sted, 3'-T af en thymin-dimer og de fleste ubeskadigede baser af gær-DNA-polymerase eta (pol eta).Fordi pyren er et ikke-polært molekyle uden H-bindingsevne, tilskrives de usædvanligt høje effektiviteter af dPMP-insertion dets overlegne basestablingsevne og understreger vigtigheden af basestabling i udvælgelsen af nukleotider med pol eta.For at undersøge rollen af H-binding og basepargeometri i udvælgelsen af nukleotider ved pol eta, bestemte vi insertionseffektiviteten af de basemodificerede nukleotider 2,6-diaminopurin, 2-aminopurin, 6-chlorpurin og inosin, som ville lav et forskelligt antal H-bindinger med skabelonbasen afhængigt af basepars geometri.Watson-Crick-baseparring ser ud til at spille en vigtig rolle i udvælgelsen af nukleotidanaloger til insertion modsat C og T, hvilket fremgår af faldet i den relative insertionseffektivitet med et fald i antallet af Watson-Crick H-bindinger og en stigning i antallet af donor-donor og acceptor-acceptor interaktioner.Selektiviteten af nukleotid-insertion er større modsat 5'-T end 3'-T af thymin-dimeren, i overensstemmelse med tidligere arbejde, der tyder på, at 5'-T holdes mere stift end 3'-T.Endvidere synes insertion af A modsat begge T'er af dimeren at være medieret af Watson-Crick baseparring og ikke af Hoogsteen baseparring baseret på de næsten identiske insertionseffektiviteter af A og 7-deaza-A, hvoraf sidstnævnte mangler H- bindingsevne ved N7.De relative effektiviteter for insertion af nukleotider, der kan danne Watson-Crick-basepar, er parallelle med dem for Klenow-fragmentet, hvorimod Klenow-fragmentet i højere grad diskriminerer mod fejlparringer i overensstemmelse med dets større formselektivitet.Disse resultater understreger vigtigheden af H-binding og Watson-Crick basepargeometri i udvælgelsen af nukleotider af både pol eta og Klen ow-fragmentet og den mindre rolle, formselektion spiller i insertion af pol eta på grund af dets mere åbne og mindre begrænset aktivt websted.