Produkter

Den forudsigelige 3D-struktur af dobbeltstrenget DNA gør det ideelt egnet som skabelon til bottom-up design af funktionaliserede nukleinsyrebaserede aktive steder.Vi udforsker her brugen af ​​en 14mer DNA-duplex som et stillads til den præcise og forudsigelige positionering af katalytiske funktionaliteter.I betragtning af den allestedsnærværende deltagelse af den histidin-baserede imidazolgruppe i proteingenkendelse og katalysebegivenheder, blev enkelte histidinlignende modificerede duplekser undersøgt.Tethering af histamin til C5 i thyminbasen via en amidbinding muliggør fleksibel placering af imidazolfunktionen i hovedrillen.De gensidige interaktioner mellem imidazolen og duplexen og dens indflydelse på imidazolium pKaH undersøges ved at placere en enkelt modificeret thymin i fire forskellige positioner i midten af ​​den 14mer dobbelthelix.Ved hjælp af NMR og uhæmmet molekylær dynamik etableres et strukturelt motiv, der involverer dannelsen af ​​en hydrogenbinding mellem imidazolen og Hoogste en-siden af ​​guaninbaserne af to nabostillede GC-basepar.Motivet bidrager til en stabilisering mod termisk smeltning på 6°C og er nøglen til at modulere imidazoliumgruppens pKaH.De generelle træk, forudsætninger og generiske karakter af det nye pKaH-regulerende motiv er beskrevet.