Produkter

Infrarød spektroskopi er blevet brugt til at kortlægge substrat-protein-interaktioner: de konformationelle ændringer af det sarkoplasmatiske reticulum Ca(2+)-ATPase efter nukleotidbinding og ATPase-phosphorylering blev overvåget ved hjælp af substrat-ATP- og ATP-analogerne (2'-deoxy-ATP, 3 '-deoxy-ATP og inosin 5'-triphosphat), som blev modificeret ved specifikke funktionelle grupper af substratet.Modifikationer af 2'-OH, 3'-OH og aminogruppen af ​​adenin reducerer omfanget af bindingsinduceret konformationel ændring af ATPase, med særligt stærke effekter observeret for de to sidstnævnte.Dette viser nukleotid-ATPase-kompleksets strukturelle følsomhed over for individuelle interaktioner mellem nukleotid og ATPase.Alle undersøgte grupper er vigtige for binding, og interaktioner af en given ligandgruppe med ATPase afhænger af interaktioner mellem andre ligandgrupper.Fosforylering af ATPasen blev observeret for ITP og 2'-deoxy-ATP, men ikke for 3'-deoxy-ATP.Der er ingen direkte forbindelse mellem omfanget af konformationsændring ved nukleotidbinding og phosphoryleringshastigheden, hvilket viser, at det fulde omfang af den ATP-inducerede konformationsændring ikke er obligatorisk for phosphorylering.Som observeret for nukleotid-ATPase-komplekset afhænger konformationen af ​​det første phosphorylerede ATPase-mellemprodukt E1PCa(2) også af nukleotidet, hvilket indikerer, at ATPase-tilstande har en mindre ensartet konformation end tidligere forventet.